Très peu de personnes ayant le TSAF présentent des traits faciaux caractéristiques. Ces traits (fentes palpébrales courtes, philtrum lisse, lèvre supérieure mince) sont présents s’il y a consommation d’alcool entre les 18e et 21e jours de la grossesse. Il n’y a pas de lien direct entre les traits faciaux caractéristiques du TSAF et les capacités intellectuelles de la personne.